Python Psi4とRDKitが動くJupyter Lab環境をDockerで構築してみた
Dockerを使い、Psi4とRDKitが導入済みのJupyter Lab環境を構築する方法を解説。ライブラリの依存関係や競合問題を解決し、再現性の高い化学計算・ケモインフォマティクスの研究開発環境を容易に準備する手順を紹介します。
化学でデータサイエンス
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化学でデータサイエンス DockerでRDKitが使えるケモインフォマティクス環境構築【py3Dmol・PubChemPyも】
DockerとVS Codeでrdkit・py3Dmol・PubChemPyが動く再現性の高いケモインフォマティクス環境を構築する手順を詳しく解説。Dockerfile、docker-compose、Jupyter連携、2D/3D分子表示まで一気に学べます。
化学でデータサイエンス 【RDKit入門】SMILESで同一分子を簡単に判別する方法
RDKitを使ったSMILES表記の重複分子判別方法を解説。標準化SMILESやキラリティ無視の判別法など、化学データ解析や機械学習の前処理で役立つ実践的なコード例を詳しく紹介します。初心者にもわかりやすく解説！